旅途中，遇见小精灵训练家小玲的小智一行人，为了让疲累的小精灵们休息，于是前往最近的小精灵中心。该中心所在城市名为「绿色原野」。这应该是个使人心境祥和的地方吧……

在广大的馆里独自孤独生活的少女小米。某夜，因为将下落不明的父亲修里所留下的奇妙文字卡排列之后，让谜样的「未知图腾」出现。此举，使得整个「绿色原野」开始结晶起来。现身在被突如其来的结晶化现象所吓到的小智一行人面前的是——梦幻的小精灵「炎帝」。

不知怎地，炎帝竟然将小智的妈妈带往结晶塔去了！小智一行人是否能够将妈妈平安无事地解救回来呢？

描写爱与勇气以及亲子间的牵绊，扣人心弦的宠物小精灵冒险！